Krok 1: Výběr molekuly

Nejprve programu řekni, jakou látku chceš modelovat. Můžeš využít automatický import nebo nahrát vlastní data.

Obr. 1: Zobrazení vyhledávání z PubChemu

• 1
  Vyhledávání: Zadej anglický název látky do pole "Search on PubChem" a stiskni Enter. Data se automaticky stáhnou z veřejné databáze.
• 2
  Vlastní data: Pokud máš vlastní .sdf soubor, použij tlačítko Upload File a následně Fetch Data.

Krok 2: Rozhraní pro zobrazení

Po načtení dat se ti zpřístupní nastavení modelu. Prvním krokem je výběr reprezentace molekuly.

Obr. 2: UI ukázka s rozbaleným menu pro reprezentaci

Krok 3: Volba typu zobrazení

Vyber si vzhled, který nejlépe vyhovuje tvým potřebám pro výuku nebo 3D tisk.

Obr. 3: Nabídka rozbalovacího menu

• 3
  Select Model Type: Zvol požadovaný vzhled (Spheres, Ball-and-Stick, Sticks, nebo náš tajný Minecraft režim).

Krok 4: Nastavení parametrů a export

Přizpůsob si detail a proporce modelu tak, aby se co nejlépe tiskl. Najetím myší na jednotlivé možnosti níže uvidíš, jak parametry vizuálně mění výsledek.

Výchozí kvalita sítě (Quality: 50)

Nízká kvalita (Quality: 5)

Skrytí vodíků (Hydrogens)

Výchozí Ball-and-Stick

Zobrazení násobných vazeb

Jednotný průměr (Uniform Atom Diameter)

Oddělené vazby (Group Bonds Separately)

Větší měřítko (Multiplication Factor: 1.5)

Tloušťka vazeb (Bond Diameter: 0.6)

Výchozí kvalita sítě (Quality: 50)

Standardní nastavení pro hezký a hladký sférický model.

Obr. 4: Parametry modelu a možnosti exportu

• 4
  Model Settings: Zde můžeš upravit kvalitu, velikost modelu, průměr vazeb nebo zobrazení vodíků.
• 5
  Možnosti exportu: Tlačítko Download Template stáhne čistá .sdf data molekuly. Modré tlačítko One STL File exportuje sloučený jednobarevný model.
• 6
  Finální vícebarevný export: Zeleným tlačítkem Download Model stáhneš .zip archiv s modely oddělenými po atomech pro snazší přiřazení barev ve sliceru.

Krok 5: Aplikace změn (Reload)

Na obrázku vidíš složitější model (ATP). Pamatuj, že po jakékoliv úpravě v sekci Model Settings se náhled neaktualizuje sám.

Obr. 5: Ukázka modelu ATP a žlutého tlačítka Reload

• 7
  Tlačítko Reload: Kdykoliv upravíš nastavení, vždy nejprve klikni na toto žluté tlačítko. Tím aplikuješ změny do 3D náhledu.

Jak importovat do sliceru?

Pro vícebarevný tisk molekuly se ujisti, že tě slicer upozorní hláškou
„Byl detekován objekt o více částech“ (Multi-part object detected),
a následně potvrď volbou „ANO“ (YES).