O projektu

Kdo jsme

Projekt je dílem spolupráce mezi akademickými pracovišti a studenty. Toto spojení odborníků z medicíny, biochemie, výpočetní techniky a vzdělávání zaručuje, že nástroj je metodologicky i technicky vyvážený.

Projekt je dílem spolupráce mezi akademickými pracovišti a studenty:
• Ústav učitelství chemie a humanitních věd VŠCHT Praha
• 1. lékařská fakulta Univerzity Karlovy

Proč vznikl

Věříme, že pro porozumění tvaru, prostorovým interakcím a vlastnostem bioorganických molekul je klíčové mít možnost pracovat s jednoduše srozumitelnými 3D modely. Digitální vizualizace je užitečná, ale často omezená – vyžaduje specializovaný software a není ideální pro výuku či fyzickou demonstraci. Tvorba fyzických modelů molekul pomocí stavebnic je časově i technicky náročná, a příprava tisknutelných modelů bývá složitá. Proto vznikl náš projekt: udělat 3D tisk molekul dostupnějším, rychlejším a přívětivým.

Co umí

Naše aplikace umožňuje:

• Automatický import molekulárních dat ze služeb jako PubChem
• Nahrání vlastních souborů (.sdf)
• Generování 3D modelu ve různých reprezentacích
• Barevné rozlišení atomů a možnost volby kvality modelu
• Optimalizaci modelu pro tisk a export pro slicery (např. PrusaSlicer)
• Podpora vícebarevného 3D tisku modelů molekul

Díky aplikaci lze zkrátit dobu přípravy tiskového modelu z molekulárních dat na jednotky minut – výrazně efektivněji než při manuálním zpracování.

Technické základy

• Jazyk: TypeScript
• GUI: SvelteKit, Bootstrap
• Datová integrace: propojení s veřejnými databázemi (PubChem, COD)
• Reprezentace: van der Waals (space-filling, Speheres), Ball-and-Stick, Stick
• Optimalizace: nastavení detailu, přidání atomů vodíku, jemnost modelu a další...
• Export výstupů: tiskové formáty připravené pro slicery

Cílem je zpřístupnit 3D tisk molekul co největšímu publiku — studentům, výzkumníkům i pedagogům.